RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 OMPP47874 163 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 VITQ6UXI7 678 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 OR52K2Q8NGK3 314 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 IMPDH1P20839 514 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PRPS1L1P21108 318 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 HOXC12P31275 282 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PDX1P52945 283 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 RAB15P59190 212 aa8.39□□□□□ -1.07
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