RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 IL12AP29459 219 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NAE1Q13564 534 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DPYSL2Q16555 572 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NRF1Q16656 503 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CARD16Q5EG05 197 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 AADACL2Q6P093 401 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TNS4Q8IZW8 715 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SFRP1Q8N474 314 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PIGXQ8TBF5 258 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TNFRSF25Q93038 417 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RIPK3Q9Y572 518 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CPQQ9Y646 472 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 HAT1O14929 419 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 COQ9O75208 318 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LRCH4O75427 683 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GPIP06744 558 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GRK6P43250 576 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DCST1Q5T197 706 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRF1Q5T601 910 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TDRPQ86YL5 185 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SVOPLQ8N434 492 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FAR1Q8WVX9 515 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RGMAQ96B86 450 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FZD8Q9H461 694 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CD248Q9HCU0 757 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RNF19AQ9NV58 838 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MARK1Q9P0L2 795 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 BTRCQ9Y297 605 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LRATO95237 230 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SHBGP04278 402 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LIMK2P53671 638 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 BST1Q10588 318 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MAPK11Q15759 364 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 UBXN11Q5T124 520 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 BICRALQ6AI39 1079 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NEK7Q8TDX7 302 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DGAT2Q96PD7 388 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NMUR1Q9HB89 426 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CD247P20963 164 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FGFR3P22607 806 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GSSP48637 474 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LCP2Q13094 533 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NDC1Q9BTX1 674 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 OR2AG2A6NM03 316 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GABRDO14764 452 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SCN2BO60939 215 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 HCAR3P49019 387 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CLCN7P51798 805 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GRB14Q14449 540 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 HID1Q8IV36 788 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00471Q8N535 108 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.32□□□□□ -1.4
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