RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS4BO75351 444 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 LEFTY1O75610 366 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ACRV1P26436 265 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 MTHFRP42898 656 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 AGTR2P50052 363 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 HK3P52790 923 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 TGFBIQ15582 683 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF423Q2M1K9 1284 aa19.97■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 CRTC1Q6UUV9 634 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 SMRP1Q8NCR6 262 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 OR56A4Q8NGH8 313 aa19.97■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 HGH1Q9BTY7 390 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC25A23Q9BV35 468 aa19.97■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 THOP1P52888 689 aa19.97■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO48Q5FWF7 155 aa19.97■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 USP45Q70EL2 814 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 FRA10AC1Q70Z53 315 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 HIPK4Q8NE63 616 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 HLA-EP13747 358 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 LHCGRP22888 699 aa19.96■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 CHRNA6Q15825 494 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM219BQ5XKK7 198 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 KBTBD6Q86V97 674 aa19.96■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 UGT1A1P22309 533 aa19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 UGT1A4P22310 534 aa19.95■□□□□ 0.78
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PACSIN3-211ENST00000539589 UGT1A5P35504 534 aa19.95■□□□□ 0.78
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 PACSIN3Q9UKS6 424 aa19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00032P0C843 101 aa19.95■□□□□ 0.78
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PACSIN3-211ENST00000539589 REP15Q6BDI9 236 aa19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 DHDDSQ86SQ9 333 aa19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 SUSD6Q92537 303 aa19.95■□□□□ 0.78
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PACSIN3-211ENST00000539589 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1B0GTL3 188 aa19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 S100BP04271 92 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 GPX3P22352 226 aa19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 DPP6P42658 865 aa19.94■□□□□ 0.78
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PACSIN3-211ENST00000539589 ST8SIA6P61647 398 aa19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 PTSQ03393 145 aa19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 LRP8Q14114 963 aa19.94■□□□□ 0.78
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF234Q14588 700 aa19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
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PACSIN3-211ENST00000539589 MACC1Q6ZN28 852 aa19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 SYVN1Q86TM6 617 aa19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO1HQ8N1T3 1032 aa19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 NXPE1Q8N323 547 aa19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3-211ENST00000539589 B4GALT6Q9UBX8 382 aa19.94■□□□□ 0.78
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