RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	VAPB	O95292	243 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	MPO	P05164	745 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	EPHA4	P54764	986 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	C2orf54	Q08AI8	447 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	ST3GAL2	Q16842	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	HOOK3	Q86VS8	718 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	MPP5	Q8N3R9	675 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	NCSTN	Q92542	709 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	ELMO1	Q92556	727 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	TREX1	Q9NSU2	369 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SATB2	Q9UPW6	733 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SPEG	Q15772	3267 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PTPRB	P23467	1997 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	LILRA5	A6NI73	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SMAP	O00193	183 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	FANCG	O15287	622 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	B4GAT1	O43505	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	JMJD7	P0C870	316 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	BRAF	P15056	766 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	ITGB6	P18564	788 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SLC19A1	P41440	591 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PTGIR	P43119	386 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	BRD3	Q15059	726 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	RPE65	Q16518	533 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SNF8	Q96H20	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SGSM3	Q96HU1	749 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	BPTF	Q12830	3046 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SGTA	O43765	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	OR1I1	O60431	355 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	BRINP1	O60477	761 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	USP1	O94782	785 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	UBXN7	O94888	489 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	TYRP1	P17643	537 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	NDUFS1	P28331	727 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CD1C	P29017	333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CCKBR	P32239	447 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PDX1	P52945	283 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SEMA3A	Q14563	771 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	RTP5	Q14D33	572 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	TMED2	Q15363	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	BBS9	Q3SYG4	887 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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