RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 H3BMM5 538 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFRSF10CO14798 259 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 KMOO15229 486 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 SDC3O75056 442 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 FTH1P02794 183 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 C2P06681 752 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 JUNDP17535 347 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 CNTFP26441 200 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 AOAHP28039 575 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 PDHA2P29803 388 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 SERPINB8P50452 374 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 OVGP1Q12889 678 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 TEAD4Q15561 434 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 AMZ2Q86W34 360 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2I1PQ8NGU4 316 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 TCEAL3Q969E4 200 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP192Q8TEP8 1941 aa22.33■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A096LPK6 155 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP8P85298 464 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CTBSQ01459 385 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB2Q8N680 514 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 PANX3Q96QZ0 392 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF358Q9NW07 568 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 DHRS7Q9Y394 339 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFP01375 233 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT4P19013 534 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 IL9RQ01113 521 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TTMPQ5BVD1 217 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TRABD2AQ86V40 505 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2L2Q8NH16 312 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM174AQ8TBP5 190 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 MTBPQ96DY7 904 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 RMI1Q9H9A7 625 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB23Q9ULC3 237 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 MGAT4DA6NG13 374 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX2O60749 519 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR89BP0CG08 455 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 DLG1Q12959 904 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SH3GL2Q99962 352 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SUSD2Q9UGT4 822 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CDYLQ9Y232 598 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 MPLP40238 635 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CTSKP43235 329 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 GRIK2Q13002 908 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SYTL3Q4VX76 610 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SH2D5Q6ZV89 423 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SFTPA2Q8IWL1 248 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 KCTD4Q8WVF5 259 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 INPP5DQ92835 1189 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 PGM2Q96G03 612 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC61Q9BV99 259 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 COG4Q9H9E3 785 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 IL21RQ9HBE5 538 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 IKZF3Q9UKT9 509 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 QSOX1O00391 747 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 SPAG7O75391 227 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 EML2O95834 649 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CSF2P04141 144 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC166P0CW27 439 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEA12P43365 314 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CSRP3P50461 194 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 IRX4P78413 519 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 CSHL1Q14406 222 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 DUOXA1Q1HG43 343 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-208ENST00000524325 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms