RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 MFSD3Q96ES6 412 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ZBP1Q9H171 429 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 DSN1Q9H410 356 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FNIP2Q9P278 1114 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SARDHQ9UL12 918 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 USP18Q9UMW8 372 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HIDE1A8MVS5 230 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 C9JVG2 144 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 RNF103O00237 685 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SDHDO14521 159 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TSPAN9O75954 239 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SBK3P0C264 359 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 NAGAP17050 411 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CES1P23141 567 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ASPAP45381 313 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 POU6F1Q14863 301 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MEP1AQ16819 746 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HID1Q8IV36 788 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 OR13J1Q8NGT2 312 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MUL1Q969V5 352 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SNX18Q96RF0 628 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 AGAP2Q99490 1192 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 DUSP16Q9BY84 665 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MTMR11A4FU01 709 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 H3BUI4 141 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CYBBP04839 570 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CAPN1P07384 714 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MGAT1P26572 445 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 IRS1P35568 1242 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ADIGQ0VDE8 80 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 OLIG2Q13516 323 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP69Q49AA0 526 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HLA-CQ95604 372 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HSFY1Q96LI6 401 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 EXD2Q9NVH0 621 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 C12orf71A8MTZ7 269 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TGM5O43548 720 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TCF3P15923 654 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 EPCAMP16422 314 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ITGB6P18564 788 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 IL10P22301 178 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HTR2BP41595 481 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GPD2P43304 727 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CBLBQ13191 982 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SELPLGQ14242 412 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 AGAP6Q5VW22 663 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FAM205BPQ63HN1 556 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 RETREG3Q86VR2 466 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PELI3Q8N2H9 469 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 AGAP4Q96P64 663 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 STMN3Q9NZ72 180 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GRAP2O75791 330 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SOAT2O75908 522 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ALBP02768 609 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CYP11A1P05108 521 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 NCK1P16333 377 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CTRB1P17538 263 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SAT1P21673 171 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEA6P43360 314 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 OR3A3P47888 321 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN10P78369 228 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 STX5Q13190 355 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HECTD3Q5T447 861 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 STRADAQ7RTN6 431 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms