RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520177.5

G3BP1-208, Transcript of G3BP stress granule assembly factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene G3BP1, Length 2,700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1-208ENST00000520177 G6PDP11413 515 aa14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 Q6ZSR9 355 aa14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 BEND5Q7L4P6 421 aa14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 PSMG2Q969U7 264 aa14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 PCTPQ9UKL6 214 aa14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 U3KQV3 271 aa14.71□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SYCE1LA8MT33 242 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 DFNA5O60443 496 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 GSSP48637 474 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 CDC42EP1Q00587 391 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 EPS8Q12929 822 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 DGCR6Q14129 220 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 DGUOKQ16854 277 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 OR2T12Q8NG77 320 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 OR10A6Q8NH74 314 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 ACTR8Q9H981 624 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SIAEQ9HAT2 523 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 VAPAQ9P0L0 249 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 FBXO10Q9UK96 956 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 BTN3A1O00481 513 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SLC22A1O15245 554 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 PCYT1AP49585 367 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 NCS1P62166 190 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 IL5RAQ01344 420 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 GALNT3Q14435 633 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 PGBD5Q8N414 524 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 OR4L1Q8NH43 312 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 RORBQ92753 470 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 DERL2Q9GZP9 239 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 KATNBL1Q9H079 304 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 ACTL8Q9H568 366 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SP110Q9HB58 689 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 MED16Q9Y2X0 877 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 MGEA5O60502 916 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 FMO3P31513 532 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 STC1P52823 247 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 CDK5R2Q13319 367 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 C6orf183Q5T699 404 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 ZNF691Q5VV52 312 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SPC25Q9HBM1 224 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 CEP350Q5VT06 3117 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 PRKD3O94806 890 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 FTH1P02794 183 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 HTR6P50406 440 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 RAD51Q06609 339 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 SLC13A2Q13183 592 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 PWP1Q13610 501 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 RAPSNQ13702 412 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 CCDC80Q76M96 950 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 GAD1Q99259 594 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 GPR21Q99679 349 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 USE1Q9NZ43 259 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 C3orf18Q9UK00 162 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-208ENST00000520177 LCHNA4D1U4 455 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms