RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	C18orf12	Q96KH6	178 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	IWS1	Q96ST2	819 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	MIOS	Q9NXC5	875 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CDK1-208	ENST00000519760	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1B0GVC2	190 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	DNM1L	O00429	736 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	OGG1	O15527	345 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	GPR137B	O60478	399 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	DAB1	O75553	588 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	CSPG5	O95196	566 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	MOCS3	O95396	460 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	EML2	O95834	649 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	CLEC3B	P05452	202 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	HMBS	P08397	361 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	RARG	P13631	454 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	GPR143	P51810	404 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	PPARD	Q03181	441 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	MFAP5	Q13361	173 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	ENPP2	Q13822	863 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	P2RY6	Q15077	328 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF383	Q8NA42	475 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	GRHL3	Q8TE85	626 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	SGCD	Q92629	289 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	MOCOS	Q96EN8	888 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	C1orf74	Q96LT6	269 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	SYT11	Q9BT88	431 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		2.58	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760		E9PQ18	207 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	RAF1	P04049	648 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	HIST1H2AB	P04908	130 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	HIST1H2AD	P20671	130 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	KRT9	P35527	623 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	PSMC4	P43686	418 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	KCNJ10	P78508	379 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	CORO6	Q6QEF8	472 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760		Q6ZSR9	355 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	OR2A14	Q96R47	310 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	HGH1	Q9BTY7	390 aa		2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	NFKBIA	P25963	317 aa		2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	NMBR	P28336	390 aa		2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	SLC6A12	P48065	614 aa		2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	DCAF10	Q5QP82	559 aa		2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	ALS2CL	Q60I27	953 aa		2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	KLC3	Q6P597	504 aa		2.56	□□□□□ -2
CDK1-208	ENST00000519760	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		2.56	□□□□□ -2

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