RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL35Q6PF15 583 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 C19orf48Q6RUI8 117 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 USP24Q9UPU5 2620 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 POLBP06746 335 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 HGFP14210 728 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 TPSB2P20231 275 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMA3P25788 255 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 TPSAB1Q15661 275 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 RPE65Q16518 533 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 OR4L1Q8NH43 312 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 HM13Q8TCT9 377 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 COG1Q8WTW3 980 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 DPH1Q9BZG8 443 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 WWP1Q9H0M0 922 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 A8MU76 341 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 CDRT15L2A8MXV6 281 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 PHF2O75151 1096 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 THRAP10827 490 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 TYRP1P17643 537 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 ARSDP51689 593 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 TERF1P54274 439 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 PLCL1Q15111 1095 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP1B1Q16678 543 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 CLEC14AQ86T13 490 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 C12orf66Q96MD2 445 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR70Q9NW82 654 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 APC2O95996 2303 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-210ENST00000505941 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 FTH1P02794 183 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 OR56A5P0C7T3 313 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC5A2P31639 672 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 CSF2RBP32927 897 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 FNTAP49354 379 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 CFHR1Q03591 330 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR18Q14330 331 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 DBN1Q16643 649 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 PDP2Q9P2J9 529 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL3Q9UH77 587 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 OR51F1A6NGY5 319 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 PFDN6O15212 129 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 KLK10O43240 276 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 PRSS56P0CW18 603 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 ITIH1P19827 911 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 NDUFS1P28331 727 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 FOXN2P32314 431 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R7Q15435 360 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC27Q6P3X3 843 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM129CQ86XR2 697 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 NAT14Q8WUY8 206 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 USP7Q93009 1102 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 SGSM3Q96HU1 749 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 TAAR9Q96RI9 348 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 LHX6Q9UPM6 363 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 CTAGE9A4FU28 777 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 USP27XA6NNY8 438 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF185O15231 689 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-210ENST00000505941 SGTAO43765 313 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms