RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ADCY2Q08462 1091 aa22.06■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 NFE2L1Q14494 772 aa22.06■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 PLCL1Q15111 1095 aa22.06■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 IGFBP7Q16270 282 aa22.06■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 METRNLQ641Q3 311 aa22.06■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CNGA4Q8IV77 575 aa22.06■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.06■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.06■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 KLHL33A6NCF5 533 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 TLCD2A6NGC4 264 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 OR2AG2A6NM03 316 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 RFPL1O75677 317 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 TIAF1O95411 115 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 FOLR1P15328 257 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 PMS2P54278 862 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 LLGL1Q15334 1064 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CT55Q8WUE5 264 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ZFPM2Q8WW38 1151 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 SEC14L1Q92503 715 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 TWSG1Q9GZX9 223 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ALG6Q9Y672 507 aa22.05■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 PIPSLA2A3N6 862 aa22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CDC14CA4D256 554 aa22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 F5H423 210 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 STX7O15400 261 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CA5AP35218 305 aa22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNAB1Q14722 419 aa22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K3Q99759 626 aa22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKMY1Q9P2S6 941 aa22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ACSL5Q9ULC5 683 aa22.04■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CLEC18AA5D8T8 446 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 OR5K3A6NET4 321 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 MGAT4DA6NG13 374 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 PRAMEF1O95521 474 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 MSH3P20585 1137 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 AKT1P31749 480 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 XRCC4Q13426 336 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CLEC18BQ6UXF7 455 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CARFQ8N187 725 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 D2HGDHQ8N465 521 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CLEC18CQ8NCF0 446 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF398Q8TD17 642 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 HAUS1Q96CS2 278 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR87Q9BY21 358 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ACTL8Q9H568 366 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 FGF21Q9NSA1 209 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.03■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ANXA9O76027 345 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 EBLN1P0CF75 366 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 PYGMP11217 842 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ARL4DP49703 201 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 HSD11B2P80365 405 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM135Q86UB9 458 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 OOSP2Q86WS3 158 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 TEX19Q8NA77 164 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 OR2L2Q8NH16 312 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 GBA3Q9H227 469 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 HRASLS2Q9NWW9 162 aa22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 NR1D1P20393 614 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 GEMP55040 296 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 TUBB4BP68371 445 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 TUBB2AQ13885 445 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 ASB18Q6ZVZ8 466 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 BBS12Q6ZW61 710 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 OR8K5Q8NH50 307 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 MIB2Q96AX9 1013 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 C12orf66Q96MD2 445 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 WWP1Q9H0M0 922 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa22.01■■□□□ 1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 TLK1Q9UKI8 766 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms