RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 ASZ1Q8WWH4 475 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 CD274Q9NZQ7 290 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 FBXL21Q9UKT6 434 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 VEGFDO43915 354 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 CHRNGP07510 517 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 GBX1Q14549 363 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 MAP7D1Q3KQU3 841 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 HEATR4Q86WZ0 1026 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 HORMAD1Q86X24 394 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 CCM2Q9BSQ5 444 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 RAP2CQ9Y3L5 183 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 SNX2O60749 519 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 GABRG2P18507 467 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 IFT88Q13099 833 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 TGFBIQ15582 683 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF678Q5SXM1 525 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 SBSNQ6UWP8 590 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 CYHR1Q6ZMK1 362 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 FLCNQ8NFG4 579 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 KLK6Q92876 244 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 SHDQ96IW2 340 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 SIKE1Q9BRV8 207 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 SLC17A9Q9BYT1 436 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 KDM4CQ9H3R0 1056 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 LMAN1LQ9HAT1 526 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 PNPOQ9NVS9 261 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 WNT16Q9UBV4 365 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 NUAK1O60285 661 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 CCR10P46092 362 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 DGKEP52429 567 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 ARFIP2P53365 341 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 PRKAA1Q13131 559 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 FGL2Q14314 439 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 BCL7AQ4VC05 210 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF781Q8N8C0 355 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 HMGB4Q8WW32 186 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 COX14Q96I36 57 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 TRMOQ9BU70 441 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 KCNK13Q9HB14 408 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 KCNK4Q9NYG8 393 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 NUDT4Q9NZJ9 180 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 ATXN10Q9UBB4 475 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 KLK8O60259 260 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 SUPT7LO94864 414 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 TARSP26639 723 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 IRF4Q15306 451 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 SYTL3Q4VX76 610 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 C6orf89Q6UWU4 347 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 FRMD7Q6ZUT3 714 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 LSMEM2Q8N112 164 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF687Q8N1G0 1237 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 STX16O14662 325 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 RAD51BO15315 384 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 S100BP04271 92 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 TEAD1P28347 426 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 TPMTP51580 245 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 HK3P52790 923 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 CDK3Q00526 305 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 INPP5AQ14642 412 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 RMDN2Q96LZ7 410 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 FAM8A1Q9UBU6 413 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 OARD1Q9Y530 152 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-210ENST00000489475 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 MPC1LP0DKB6 136 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 AQP5P55064 265 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 UBXN2BQ14CS0 331 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 PPP1R3AQ16821 1122 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 UNC50Q53HI1 259 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 SYT13Q7L8C5 426 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 PGBD3Q8N328 593 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM159Q96B96 161 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 GSTO2Q9H4Y5 243 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 WDR26Q9H7D7 661 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 HAO1Q9UJM8 370 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 KRBA1A5PL33 1030 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 GPC4O75487 556 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 SLCO2B1O94956 709 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 MPSTP25325 297 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-210ENST00000489475 RPL14P50914 215 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms