RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 PDE1BQ01064 536 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 IFT88Q13099 833 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 NAE1Q13564 534 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT24Q2M2I5 525 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 RUFY3Q7L099 469 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 CTAGE6Q86UF2 777 aa4.13□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 SYCP3Q8IZU3 236 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.13□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.13□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 RUFY1Q96T51 708 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 CMKLR1Q99788 373 aa4.13□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 CSTL1Q9H114 145 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 ZWILCHQ9H900 591 aa4.13□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 RRN3Q9NYV6 651 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 MPP6Q9NZW5 540 aa4.13□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 TAAR2Q9P1P5 351 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 A4GNTQ9UNA3 340 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.13□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 NUP155O75694 1391 aa4.13□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 ASPDHA6ND91 283 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 B4DLN1 442 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 SNAP23O00161 211 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 DVL1O14640 695 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 CAPN9O14815 690 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 E2F6O75461 281 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC22A3O75751 556 aa4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 DESP17661 470 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 MAOAP21397 527 aa4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 VAMP2P63027 116 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM173BQ6P4H8 233 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC80Q76M96 950 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 DSG4Q86SJ6 1040 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM110Q86TL2 294 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 NLRP14Q86W24 1093 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 KMT5CQ86Y97 462 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.751e-6■■■□□ 15.9
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RABGGTB-210ENST00000485459 AFAP1Q8N556 730 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 TEKT1Q969V4 418 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 JAKMIP2Q96AA8 810 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 HVCN1Q96D96 273 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 ERP27Q96DN0 273 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXO17Q96EF6 278 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM81BQ96LP2 452 aa4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-210ENST00000485459 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.751e-56■■■■■ 29.5
RABGGTB-210ENST00000485459 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D7Q9P0N9 293 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-210ENST00000485459 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
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