RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 STK39Q9UEW8 545 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIP11Q15643 1979 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SAC3D1A6NKF1 404 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 MAGEC1O60732 1142 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF682O95780 498 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 GALK1P51570 392 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC7A2P52569 658 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 PSME3P61289 254 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 PDGFRLQ15198 375 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SPRED2Q7Z698 418 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SYT12Q8IV01 421 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 PPM1MQ96MI6 270 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 IL36AQ9UHA7 158 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 DRGXA6NNA5 263 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TGDSO95455 350 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 OTCP00480 354 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SRCP12931 536 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 GPC1P35052 558 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ERVK-21P61565 698 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 AHI1Q8N157 1196 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 VPS33AQ96AX1 596 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC13A4Q9UKG4 626 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 LAMA3Q16787 3333 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A0J9YYE9 177 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC01553A4QN01 128 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 RGS14O43566 566 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 F11P03951 625 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 LCP2Q13094 533 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM240Q5SV17 173 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 STEAP4Q687X5 459 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM73Q86UV7 250 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM247A6NEH6 219 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 WNT9AO14904 365 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 LDB2O43679 373 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 MT-ND1P03886 318 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 GRIA3P42263 894 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 PRIM2P49643 509 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 IL23RQ5VWK5 629 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 C11orf74Q86VG3 221 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD46Q86W74 232 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SH3GL1Q99961 368 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ATG13O75143 517 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ABLIM3O94929 683 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TRBC1P01850 177 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 GABRB3P28472 473 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 S100A3P33764 101 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 FGF13Q92913 245 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ASB2Q96Q27 587 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ALDH1A2O94788 518 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF23P17027 643 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC34A1Q06495 639 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 NFATC2Q13469 925 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRVP-201ENST00000482597 GTF2H2Q13888 395 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms