RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460826.1

HDLBP-229, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 442 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-229	ENST00000460826	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PERM1	Q5SV97	790 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	KRT222	Q8N1A0	295 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	ARL14	Q8N4G2	192 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	GLMN	Q92990	594 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	BIRC8	Q96P09	236 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	TCF12	Q99081	682 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	KCNJ13	O60928	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	OR56A5	P0C7T3	313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	F3	P13726	295 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	VCL	P18206	1134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	IDS	P22304	550 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	GABRB3	P28472	473 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	FMO4	P31512	558 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	MAGEA4	P43358	317 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	IYD	Q6PHW0	289 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	HM13	Q8TCT9	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	QSOX1	O00391	747 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PIAS1	O75925	651 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	DKK1	O94907	266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	HAUS5	O94927	633 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	TRIM16	O95361	564 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	FTH1	P02794	183 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PDHA2	P29803	388 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CCR7	P32248	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	SLC19A1	P41440	591 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	ABCG1	P45844	678 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PREP	P48147	710 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	RPIA	P49247	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CLDN6	P56747	220 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	BRD3	Q15059	726 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	ELMO1	Q92556	727 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	NFU1	Q9UMS0	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PPM1D	O15297	605 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	RFPL3	O75679	317 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	C1QA	P02745	245 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	MGAT5	Q09328	741 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CUL1	Q13616	776 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-229	ENST00000460826	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21

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