RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 CAVIN3Q969G5 261 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ELMO2Q96JJ3 720 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 C8orf48Q96LL4 319 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SYT15Q9BQS2 421 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC17A9Q9BYT1 436 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 EDEM3Q9BZQ6 932 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 UCK2Q9BZX2 261 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 LHX9Q9NQ69 397 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP83Q9Y592 693 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TTC41PQ6P2S7 1318 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 IDSB3KWA1 339 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NCR1O76036 304 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NDUFA10O95299 355 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM49P0CI25 452 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM49CP0CI26 452 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CD53P19397 219 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 IDSP22304 550 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 UGT1A4P22310 534 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CSKP41240 450 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 BLKP51451 505 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 VAV2P52735 878 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 AMPD3Q01432 767 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TFF3Q07654 80 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP1A4Q13733 1029 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NEK5Q6P3R8 708 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ATL2Q8NHH9 583 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 WFDC5Q8TCV5 224 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TBCKQ8TEA7 893 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 EVI5LQ96CN4 794 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PCED1BQ96HM7 432 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF560Q96MR9 790 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SPAG5Q96R06 1193 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAJC7Q99615 494 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SOX7Q9BT81 388 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DPEP2Q9H4A9 486 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 FANCLQ9NW38 375 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 GAGE12BA1L429 117 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CLIC2O15247 247 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CLDN3O15551 220 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC37A4O43826 429 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SMPD2O60906 423 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TACC1O75410 805 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ASLP04424 464 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ERBB2P04626 1255 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF18P17022 549 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC9A1P19634 815 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 LMO2P25791 158 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 IGFALSP35858 605 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 LHX1P48742 406 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 HK3P52790 923 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 WNT3AP56704 352 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PFN3P60673 137 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 APBA1Q02410 837 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MPPE1Q53F39 396 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MDH1BQ5I0G3 518 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 C10orf120Q5SQS8 335 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 LIPNQ5VXI9 398 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 C3P1Q6ZMU1 363 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MACC1Q6ZN28 852 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MICU3Q86XE3 530 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR49Q8IV35 697 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CLYBLQ8N0X4 340 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 GALNT16Q8N428 558 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 FANCBQ8NB91 859 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MAGED4Q96JG8 741 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 COQ10AQ96MF6 247 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms