RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 XKR5Q6UX68 686 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PIM3Q86V86 326 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR150Q8NGU9 434 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFPM2Q8WW38 1151 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 TCF12Q99081 682 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 DKK4Q9UBT3 224 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PRSS21Q9Y6M0 314 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 LILRA5A6NI73 299 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1I1O60431 355 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 USP1O94782 785 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 FTH1P02794 183 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 C1QTNF9P0C862 333 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PDX1P52945 283 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 INHBCP55103 352 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CBLBQ13191 982 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TUBB2AQ13885 445 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 RPE65Q16518 533 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC6Q86X45 466 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 BBOF1Q8ND07 529 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10G6Q8NH81 332 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 NAT14Q8WUY8 206 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SNF8Q96H20 258 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 NAT9Q9BTE0 207 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 COG4Q9H9E3 785 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PDP2Q9P2J9 529 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SPEGQ15772 3267 aa16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 EFCAB8A8MWE9 144 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PFDN6O15212 129 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 POLBP06746 335 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LSSP48449 732 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CD151P48509 253 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 AMZ1Q400G9 498 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 NEPROQ6NW34 567 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM71Q6P5X7 295 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 USP53Q70EK8 1073 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PDIK1LQ8N165 341 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM159Q96B96 161 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 NXPE2Q96DL1 559 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ERP44Q9BS26 406 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CARD6Q9BX69 1037 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 STRADBQ9C0K7 418 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 WWP1Q9H0M0 922 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM169AQ9Y6X4 670 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 DUX1O43812 170 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFS3O75489 264 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 URI1O94763 535 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC4O95801 387 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ITGA8P53708 1063 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ADARP55265 1226 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CFHR1Q03591 330 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 NKAIN2Q5VXU1 208 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 IGF2-ASQ6U949 168 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LSMEM2Q8N112 164 aa16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms