RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 MAPK10P53779 464 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 FAM72AQ5TYM5 149 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TXNDC8Q6A555 127 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 FAM72DQ6L9T8 149 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 BNIPLQ7Z465 357 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 FAM72BQ86X60 149 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF280BQ86YH2 543 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.87■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 G3V2T6 193 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM24O15164 1050 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 PRAMEF11O60813 436 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 IGFBP4P22692 258 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 SSR2P43308 183 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CAPZA2P47755 286 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 ERVK-8P63133 956 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 DPP10Q8N608 796 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TRIB2Q92519 343 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CD84Q9UIB8 345 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 DMTF1Q9Y222 760 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 PNLIPRP1P54315 467 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 MANFP55145 182 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF607Q96SK3 696 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 RHBGQ9H310 441 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 HMG20AQ9NP66 347 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 IQCF3P0C7M6 154 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 RING1Q06587 406 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 INAQ16352 499 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 MBLAC2Q68D91 279 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 FAM156AQ8NDB6 213 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 OR7A2PQ8NGA2 310 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 NHSL1Q5SYE7 1610 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.86■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 SCELO95171 688 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 C21orf59P57076 290 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 PCLAFQ15004 111 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 KCTD21Q4G0X4 260 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CARD16Q5EG05 197 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 C14orf80Q86SX3 495 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF540Q8NDQ6 660 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 A0A1W2PQY0 241 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 PTGESO14684 152 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 IL6P05231 212 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 UGT1A6P19224 532 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 UGT1A1P22309 533 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 UGT1A4P22310 534 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 UGT1A3P35503 534 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 UGT1A5P35504 534 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 PDSS2Q86YH6 399 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 MTERF3Q96E29 417 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 MYOCQ99972 504 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 CEP290O15078 2479 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 AMD1P17707 334 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 RGS1Q08116 209 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 TRAF3Q13114 568 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 MED27Q6P2C8 311 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 OR4A15Q8NGL6 344 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 RAB23Q9ULC3 237 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 U3KQV3 271 aa15.85■□□□□ 0.13
C9orf172-201ENST00000436881 GLI3P10071 1580 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms