RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 PRKAR1AP10644 381 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PYGMP11217 842 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 MSH3P20585 1137 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 DLSTP36957 453 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5OP48047 213 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PDE1BQ01064 536 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 BCL7AQ4VC05 210 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CARFQ8N187 725 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 OR2L2Q8NH16 312 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ACTL9Q8TC94 416 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 FICDQ9BVA6 458 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM4Q9C037 500 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CROTQ9UKG9 612 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 TFR2Q9UP52 801 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD3Q9Y597 815 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC66A2RUB6 948 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 MGAT4DA6NG13 374 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 SPAG6O75602 509 aa20.52■□□□□ 0.88
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LIMS1-208ENST00000428064 KIAA0754O94854 1291 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 RECKO95980 971 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 F8A1P23610 371 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CTNNA2P26232 953 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 AKT1P31749 480 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PANX2Q96RD6 677 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PDE7BQ9NP56 450 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 KCND3Q9UK17 655 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 OR5K3A6NET4 321 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 TLCD2A6NGC4 264 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 CRTAMO95727 393 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1CAP62136 330 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 XIAPP98170 497 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 PRPSAP1Q14558 356 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 PTPRCAPQ14761 206 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 PLCL1Q15111 1095 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC181Q5TID7 509 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 ASB8Q9H765 288 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 RBP3P10745 1247 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 PSMB4P28070 264 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 ACY1Q03154 408 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 TLE1Q04724 770 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 TUBB3Q13509 450 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT6Q14141 434 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB109BQ30KR1 87 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 OOSP2Q86WS3 158 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 ULK4Q96C45 1275 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA13Q96N96 652 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 RARRES3Q9UL19 164 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 PADI1Q9ULC6 663 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 RCCD1A6NED2 376 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 C21orf140B9A014 251 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 SGTAO43765 313 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 HADHAP40939 763 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 PRLHRP49683 370 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 RWDD2BP57060 319 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf46Q6P387 395 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 DET1Q7L5Y6 550 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.49■□□□□ 0.87
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