RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF26BQ2KJY2 2108 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LILRA5A6NI73 299 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGRPO00253 132 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR1I1O60431 355 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HGFP14210 728 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LIMK2P53671 638 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPHA4P54764 986 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C16orf72Q14CZ0 275 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGF2-ASQ6U949 168 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CES3Q6UWW8 571 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PACS1Q6VY07 963 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAB11FIP2Q7L804 512 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM48Q8IWZ4 208 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFAP206Q8IYR0 622 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RCBTB1Q8NDN9 531 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR4D9Q8NGE8 314 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR150Q8NGU9 434 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLCO2A1Q92959 643 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC46A1Q96NT5 459 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WWP1Q9H0M0 922 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OGFRQ9NZT2 677 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLHL33A6NCF5 533 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLD2O14939 933 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLBP06746 335 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARNTP27540 789 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HALP42357 657 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NSG1P42857 185 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRAMEP78395 509 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR18Q14330 331 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM71Q6P5X7 295 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LSMEM2Q8N112 164 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO39Q8N4B4 442 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MCUQ8NE86 351 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HM13Q8TCT9 377 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CXorf40BQ96DE9 158 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MFSD3Q96ES6 412 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC74BQ96LY2 380 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCM2Q9BSQ5 444 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDP2Q9P2J9 529 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACSL5Q9ULC5 683 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOX13Q9UN79 622 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LOXL2Q9Y4K0 774 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACACAQ13085 2346 aa24.45■■□□□ 1.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DUX1O43812 170 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AP2A2O94973 939 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 THRAP10827 490 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAPK9P45984 424 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SARNPP82979 210 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R7Q15435 360 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FGF11Q92914 225 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SERPINB12Q96P63 405 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNFSF15O95150 251 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MLNP12872 115 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTK6Q13882 451 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CERS6Q6ZMG9 384 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCSTNQ92542 709 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPYSL5Q9BPU6 564 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COG4Q9H9E3 785 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CATSPERZQ9NTU4 200 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DSPP15924 2871 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PKD1L2Q7Z442 2459 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDRT15L2A8MXV6 281 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TYRP1P17643 537 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITIH1P19827 911 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDHA2P29803 388 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAGEA3P43357 314 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERVPABLB-1P60509 514 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C12orf66Q96MD2 445 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms