RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa16.65■□□□□ 0.26
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.63■□□□□ 0.25
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