RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 HM13Q8TCT9 377 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 RAB17Q9H0T7 212 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 GRHL1Q9NZI5 618 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CLCA2Q9UQC9 943 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CEP295Q9C0D2 2601 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 NDC80O14777 642 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 B4GAT1O43505 415 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 NDUFS3O75489 264 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 OR56A5P0C7T3 313 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ELK3P41970 407 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 HALP42357 657 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CRYMQ14894 314 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 TRADDQ15628 312 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 LONRF1Q17RB8 773 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 UNC5BQ8IZJ1 945 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 MNS1Q8NEH6 495 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR150Q8NGU9 434 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 WWP1Q9H0M0 922 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRN3Q9H3W5 708 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 COG4Q9H9E3 785 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ACSL5Q9ULC5 683 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM169AQ9Y6X4 670 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ASPMQ8IZT6 3477 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 QSOX1O00391 747 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 FTH1P02794 183 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ITGB6P18564 788 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SPIDRQ14159 915 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 NR1D2Q14995 579 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 TYSND1Q2T9J0 566 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 AMZ1Q400G9 498 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 NAPRTQ6XQN6 538 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM48Q8IWZ4 208 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC38A3Q99624 504 aa23.36■■□□□ 1.33
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UBE2E3-202ENST00000410062 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 TEX264Q9Y6I9 313 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 UNC13CQ8NB66 2214 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.35■■□□□ 1.33
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UBE2E3-202ENST00000410062 CTAGE8P0CG41 777 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR3P46089 330 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 RPE65Q16518 533 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF470Q6ECI4 717 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CILP2Q8IUL8 1156 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKMY2Q8IV38 441 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ELMO1Q92556 727 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CXorf40BQ96DE9 158 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CFAP36Q96G28 342 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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UBE2E3-202ENST00000410062 P2RY12Q9H244 342 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 KNTC1P50748 2209 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM221BA6H8Z2 402 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 TTC4O95801 387 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC35G4P0C7Q5 338 aa23.35■■□□□ 1.33
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UBE2E3-202ENST00000410062 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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UBE2E3-202ENST00000410062 NKAIN2Q5VXU1 208 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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UBE2E3-202ENST00000410062 MMGT1Q8N4V1 131 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR48Q8TAF3 677 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 PLAC1Q9HBJ0 212 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 MSRB2Q9Y3D2 182 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 GSTM1P09488 218 aa23.34■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 PDHA2P29803 388 aa23.34■■□□□ 1.33
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