RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 SOCS2O14508 198 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 OR4F21O95013 312 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 GLUD1P00367 558 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MYF6P23409 242 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CSNK1DP48730 415 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ERVPABLB-1P60509 514 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 UFM1P61960 85 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 LIPEQ05469 1076 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 AP1ARQ63HQ0 302 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 Q6ZSR9 355 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R42Q7RTR8 314 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MYO1HQ8N1T3 1032 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TNIP2Q8NFZ5 429 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PROKR1Q8TCW9 393 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 FEM1AQ9BSK4 669 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 LRRC3Q9BY71 257 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TRIM64A6NGJ6 449 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RAD51BO15315 384 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RASAL1O95294 804 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 BMP10O95393 424 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 OTCP00480 354 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 S100BP04271 92 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V1B1P15313 513 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CKMT2P17540 419 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MAPK8P45983 427 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PAGE3Q5JUK9 113 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 FAM219BQ5XKK7 198 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 AADATQ8N5Z0 425 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 DCAF4L2Q8NA75 395 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TEX37Q96LM6 180 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RNF38Q9H0F5 515 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 AURKCQ9UQB9 309 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PGLSO95336 258 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SEC24AO95486 1093 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RGS4P49798 205 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RHOAP61586 193 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ARMC12Q5T9G4 340 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 NANOGP8Q6NSW7 305 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 GPR63Q9BZJ6 419 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 NANOGQ9H9S0 305 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 EGFL7Q9UHF1 273 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ANAPC2Q9UJX6 822 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 H0Y626 953 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN3O60637 253 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 BMP8BP34820 402 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PBX2P40425 430 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PTPN5P54829 565 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 VEPH1Q14D04 833 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SBSNQ6UWP8 590 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 FRA10AC1Q70Z53 315 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 KIAA2013Q8IYS2 634 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RBFAQ8N0V3 343 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CBR4Q8N4T8 237 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TRIML2Q8N7C3 387 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 FNDC5Q8NAU1 212 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 LEMD2Q8NC56 503 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PIH1D2Q8WWB5 315 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RAD9AQ99638 391 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CLSTN3Q9BQT9 956 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 BPIFA1Q9NP55 256 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ZNF639Q9UID6 485 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 GNPTGQ9UJJ9 305 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 INSL6Q9Y581 213 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TRANK1O15050 2925 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 DLGAP1O14490 977 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TLL1O43897 1013 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SNAP91O60641 907 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CYP51A1Q16850 503 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 FKBP9P1Q75LS8 142 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 EPHX4Q8IUS5 362 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CDYL2Q8N8U2 506 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 DNAJB14Q8TBM8 379 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 METTL6Q8TCB7 284 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 OSCP1Q8WVF1 389 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 VPS33AQ96AX1 596 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ALG14Q96F25 216 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PPP3R2Q96LZ3 170 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SMIM14Q96QK8 99 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CLPBQ9H078 707 aa23.42■■□□□ 1.34
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