RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF385DQ9H6B1 395 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 AKTIPQ9H8T0 292 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LATS2Q9NRM7 1088 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC167Q9P0B6 97 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PPIL1Q9Y3C6 166 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ASB1Q9Y576 335 aa3.93□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TULP3O75386 442 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MTX2O75431 263 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMG1O95456 288 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LMNAP02545 664 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF4P08620 206 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS17P08708 135 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 C1SP09871 688 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DGKAP23743 735 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 AKT1P31749 480 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NSG1P42857 185 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC6A11P48066 632 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 INHBCP55103 352 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ERVK-21P61565 698 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ST8SIA6P61647 398 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ART3Q13508 389 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MMEL1Q495T6 779 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 AGKQ53H12 422 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM78AQ5JUQ0 283 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 BRAT1Q6PJG6 821 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZVL8 140 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 HPS6Q86YV9 775 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DSELQ8IZU8 1212 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 KIRREL3Q8IZU9 778 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB2Q8N680 514 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 BPIFB1Q8TDL5 484 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 FRS2Q8WU20 508 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NPAS2Q99743 824 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 EGFL8Q99944 293 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC2A11Q9BYW1 496 aa3.92□□□□□ -1.78
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LRRTM4-201ENST00000409088 ELOVL2Q9NXB9 296 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MARK1Q9P0L2 795 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZMYM5Q9UJ78 669 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PCTPQ9UKL6 214 aa3.92□□□□□ -1.78
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LRRTM4-201ENST00000409088 WASF2Q9Y6W5 498 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PQ67 120 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 WASH3PC4AMC7 463 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 STX16O14662 325 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 FFAR2O15552 330 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4F21O95013 312 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 S100BP04271 92 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CTSLP07711 333 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CISD3P0C7P0 127 aa3.92□□□□□ -1.78
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LRRTM4-201ENST00000409088 VAC14Q08AM6 782 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPA14Q0VDF9 509 aa3.92□□□□□ -1.78
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LRRTM4-201ENST00000409088 CHSY3Q70JA7 882 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
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LRRTM4-201ENST00000409088 PELI3Q8N2H9 469 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF148Q8N7C7 305 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CDYL2Q8N8U2 506 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 OR52B6Q8NGF0 335 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 OR56A4Q8NGH8 313 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 OR9I1Q8NGQ6 314 aa3.92□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.92□□□□□ -1.78
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