RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 A0A0J9YVX5 310 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 G3V2T6 193 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 GLUD1P00367 558 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 CD68P34810 354 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 GPR1P46091 355 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ZNF789Q5FWF6 425 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 SUSD6Q92537 303 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 CEP44Q9C0F1 390 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 BRD9Q9H8M2 597 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 HCSTQ9UBK5 93 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 C3orf18Q9UK00 162 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 SCML2Q9UQR0 700 aa15.18■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 PRORSD1PA6NEY8 169 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 STK16O75716 305 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ANXA6P08133 673 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ARSAP15289 507 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 GLDCP23378 1020 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 CDK9P50750 372 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 MYBPC1Q00872 1141 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 GPR180Q86V85 440 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 OR2T12Q8NG77 320 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 KIFC1Q9BW19 673 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 TPRKBQ9Y3C4 175 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 NPHS1O60500 1241 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 XYLBO75191 536 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 C8AP07357 584 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 THRBP10828 461 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 MADCAM1Q13477 382 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ZBED5Q49AG3 693 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 PIK3R6Q5UE93 754 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ADHFE1Q8IWW8 467 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 STX19Q8N4C7 294 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 MAFKO60675 156 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 CDK14O94921 469 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 CAPGP40121 348 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 SDE2Q6IQ49 451 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 GIMAP4Q9NUV9 329 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 USE1Q9NZ43 259 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 SNX6Q9UNH7 406 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 YIPF1Q9Y548 306 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 TLL1O43897 1013 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 HTR7P34969 479 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 NAE1Q13564 534 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 MYBPC3Q14896 1274 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 THAP5Q7Z6K1 395 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 TMEM135Q86UB9 458 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 NUP205Q92621 2012 aa15.17■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 RFXANKO14593 260 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ARPC2O15144 300 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ASNA1O43681 348 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 NIPAL4Q0D2K0 466 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 TRAF3Q13114 568 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ATG14Q6ZNE5 492 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ITFG2Q969R8 447 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 OR1I1O60431 355 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ECI2O75521 394 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 ELFN1P0C7U0 828 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 DGKQP52824 942 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 SLC16A1P53985 500 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 CASP9P55211 416 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 GPR17Q13304 367 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 PIGGQ5H8A4 983 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 PPP4R4Q6NUP7 873 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 FEM1CQ96JP0 617 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 MKS1Q9NXB0 559 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 A0A1W2PQY0 241 aa15.16■□□□□ 0.02
FGD1-201ENST00000375135 EPN2O95208 641 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms