RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 FGF4P08620 206 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SBK3P0C264 359 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CXCL8P10145 99 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CCL5P13501 91 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ITIH1P19827 911 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 IMPDH1P20839 514 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V1B2P21281 511 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PTPN3P26045 913 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GRIK1P39086 918 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 KRT6CP48668 564 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CLCN5P51795 746 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ITKQ08881 620 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MGAT3Q09327 533 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 BFSP2Q13515 415 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ACOX1Q15067 660 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 JADE1Q6IE81 842 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PMF1Q6P1K2 205 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SVOPLQ8N434 492 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf60Q96EN9 201 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TXNDC15Q96J42 360 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RNF208Q9H0X6 261 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 EHD1Q9H4M9 534 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 BAG5Q9UL15 447 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LACTBL1A8MY62 500 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RGS13O14921 159 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ARPC2O15144 300 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ACOX3O15254 700 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN6O43657 245 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 KRT75O95678 551 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SCGB1D2O95969 90 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NFICP08651 508 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC159P0C7I6 412 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HTR1EP28566 365 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HPCAL1P37235 193 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GLRBP48167 497 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RGS7P49802 495 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SULT1E1P49888 294 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ARPC4P59998 168 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 OSTNP61366 133 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GNA12Q03113 381 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MVKQ03426 396 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SCAPQ12770 1279 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NME3Q13232 169 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DLG2Q15700 870 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TECRLQ5HYJ1 363 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 AKAP14Q86UN6 197 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SETD9Q8NE22 299 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 USP33Q8TEY7 942 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC58Q96CX6 371 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ELMO2Q96JJ3 720 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MARK4Q96L34 752 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GPR78Q96P69 363 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB118Q96PH6 123 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DPP3Q9NY33 737 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MTRRQ9UBK8 725 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa7.11□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.11□□□□□ -1.27
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