RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 LONP2Q86WA8 852 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEP57Q86XR8 500 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NME8Q8N427 588 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO39Q8N4B4 442 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAB21L3Q8N8X9 362 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 POGLUT1Q8NBL1 392 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 POC1AQ8NBT0 407 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RDM1Q8NG50 284 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR20Q8TBZ3 569 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMPDL3BQ92485 455 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERP27Q96DN0 273 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF583Q96ND8 569 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A12Q96S37 553 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC1Q9BTT6 524 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 HHATLQ9HCP6 504 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIOSQ9NXC5 875 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 YIPF1Q9Y548 306 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRPV2Q9Y5S1 764 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GUV1 79 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PS18 150 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBC2A0A5B9 178 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DVL1O14640 695 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAPN9O14815 690 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSX4O60224 188 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR137BO60478 399 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLOD3O60568 738 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CREG1O75629 220 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 WISP2O76076 250 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIPFP07098 398 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CETPP11597 493 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSF2RAP15509 400 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMD1P17707 334 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GM2AP17900 193 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMC4P43686 418 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAPZA2P47755 286 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP15P51511 669 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF132P52740 706 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERVFC1-1P60608 527 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE5Q13069 117 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE6Q13070 117 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL11RAQ14626 422 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NR1D2Q14995 579 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASA2Q15283 850 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNAPC1Q16533 368 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASPRV1Q53RT3 343 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf152Q5JTZ5 239 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDSS1Q5T2R2 415 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCNT6Q5T4J0 391 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERMARDQ5T6L9 678 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEX38Q6PEX7 206 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD8Q6ZWB6 473 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFLNBQ8N5W9 214 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KBTBD3Q8NAB2 608 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD6Q8NC69 237 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA4DQ92854 862 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD101Q93033 1021 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTERQ96BW5 349 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERLEC1Q96DZ1 483 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTERF3Q96E29 417 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABHD8Q96I13 439 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM81BQ96LP2 452 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MS4A10Q96PG2 267 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEK1Q96PY6 1258 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTAGE1Q96RT6 745 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERINC2Q96SA4 455 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC106Q9BWC9 280 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLA2Q9H6Q3 261 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRPC7Q9HCX4 862 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANAPC2Q9UJX6 822 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF580Q9UK33 172 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAG1Q86YV5 1406 aa2.59□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0G2JNG1 304 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 C16orf97H3BN30 126 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 IKBKBO14920 756 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TO15178 435 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNGR3O43761 229 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 LDLRP01130 860 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV4-39P01824 125 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 H1F0P07305 194 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYBL1P10243 752 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms