RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309352.3

MRPL38-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L38, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPL38, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38-201ENST00000309352 ATP6V1G2O95670 118 aa22.14■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 PKNOX1P55347 436 aa22.14■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.14■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 CHSY3Q70JA7 882 aa22.14■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.14■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 POU5F2Q8N7G0 328 aa22.14■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 GLYATL1Q969I3 302 aa22.14■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 ZNF385DQ9H6B1 395 aa22.14■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.13■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 PELI3Q8N2H9 469 aa22.13■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.13■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.12■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.12■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 ZNF576Q9H609 170 aa22.12■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.12■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 TBX10O75333 385 aa22.11■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 TTC23LQ6PF05 361 aa22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.137e-7■■■□□ 15.1
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MRPL38-201ENST00000309352 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 WWOXQ9NZC7 414 aa22.11■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 MTX2O75431 263 aa22.11■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 GTF2H2Q13888 395 aa22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 MAPRE2Q15555 327 aa22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.11■■□□□ 1.13
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MRPL38-201ENST00000309352 ELMO1Q92556 727 aa22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 NUS1Q96E22 293 aa22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 PIP5K1BO14986 540 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 SLC16A5O15375 505 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 SPINT1O43278 529 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 TM7SF2O76062 418 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 OTCP00480 354 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 ANXA5P08758 320 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 HIST1H2ADP20671 130 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 CPOXP36551 454 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 TNFRSF4P43489 277 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 PSMD8P48556 350 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL38-201ENST00000309352 RAP1GDS1P52306 607 aa22.1■■□□□ 1.13
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