RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 HM13Q8TCT9 377 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 SLC22A12Q96S37 553 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF382Q96SR6 550 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 IPPKQ9H8X2 491 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 UTS2RQ9UKP6 389 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 RHOAP61586 193 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 HPCAP84074 193 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 NCEH1Q6PIU2 408 aa25.18■■□□□ 1.62
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RAB40C-201ENST00000248139 ZFP14Q9HCL3 533 aa25.18■■□□□ 1.62
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RAB40C-201ENST00000248139 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa25.17■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa25.17■■□□□ 1.62
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RAB40C-201ENST00000248139 ZNF711Q9Y462 761 aa25.17■■□□□ 1.62
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RAB40C-201ENST00000248139 SLC44A4Q53GD3 710 aa25.15■■□□□ 1.62
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RAB40C-201ENST00000248139 IKZF5Q9H5V7 419 aa25.15■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 NTN4Q9HB63 628 aa25.15■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 DHRS7Q9Y394 339 aa25.15■■□□□ 1.62
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RAB40C-201ENST00000248139 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.15■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa25.15■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa25.15■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 HMOX2P30519 316 aa25.14■■□□□ 1.62
RAB40C-201ENST00000248139 CAPGP40121 348 aa25.14■■□□□ 1.62
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