RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 IL1RAPQ9NPH3 570 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TDP1Q9NUW8 608 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 RHBDL2Q9NX52 303 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SUSD2Q9UGT4 822 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 GLS2Q9UI32 602 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 RIPK3Q9Y572 518 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 IFNW1P05000 195 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CTSKP43235 329 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 STARP49675 285 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SLC9B2Q86UD5 537 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CUZD1Q86UP6 607 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 OR7A2PQ8NGA2 310 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SNX27Q96L92 541 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 HSD17B14Q9BPX1 270 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM175Q9BSA9 504 aa10.43□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 DYTNA2CJ06 578 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 NR2C1P13056 603 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 IL7RP16871 459 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 GALK1P51570 392 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 LILRA4P59901 499 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 IL10RBQ08334 325 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 DLG1Q12959 904 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 RIPK1Q13546 671 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SAPCD2Q86UD0 394 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM192Q8IY95 271 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 NCSTNQ92542 709 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 KLHDC7BQ96G42 594 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF879B4DU55 563 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 RENP00797 406 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 DBTP11182 482 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CXCR1P25024 350 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CSKP41240 450 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 HSPA7P48741 367 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 VLDLRP98155 873 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CARTPTQ16568 116 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 ELOA3BQ3SY89 546 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 ARSIQ5FYB1 569 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TAC4Q86UU9 113 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SLC34A3Q8N130 599 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 FBXW8Q8N3Y1 598 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 ELOA3Q8NG57 546 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 PNPLA2Q96AD5 504 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 ADAP2Q9NPF8 381 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CASKO14936 926 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CD2P06729 351 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 VBP1P61758 197 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 JOSD2Q8TAC2 188 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 MR1Q95460 341 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A36Q96CQ1 311 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TBATAQ96M53 351 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 IL33O95760 270 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 GNAZP19086 355 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 L1CAMP32004 1257 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 KHKP50053 298 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CDK9P50750 372 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 ENPEPQ07075 957 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 DCST1Q5T197 706 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SULT1C3Q6IMI6 304 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 OR4C6Q8NH72 309 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SLC35G5Q96KT7 338 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CST11Q9H112 138 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SLC32A1Q9H598 525 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 METTL7AQ9H8H3 244 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 DHRS7Q9Y394 339 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 FAM221BA6H8Z2 402 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGEF33A8MVX0 844 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TNFRSF10BO14763 440 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 IRAK2O43187 625 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 VEGFDO43915 354 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SNAP91O60641 907 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 GABRB2P47870 512 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CCT3P49368 545 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 GDPD4Q6W3E5 623 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 LNX2Q8N448 690 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
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