RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038514.14

Nup54-201, Transcript of Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nup54, Length 2,352 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54-201ENSMUST00000038514 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 MthfsdQ3URQ7 372 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Afg1lQ3V384 480 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Arnt2Q61324 712 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Txndc15Q6P6J9 344 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Q8BWQ6 963 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Nle1Q8VEJ4 485 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gorasp1Q91X51 446 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Basp1Q91XV3 226 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 S100pbpQ9D5K4 396 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Slc6a14Q9JMA9 638 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Rgs17Q9QZB0 210 aa14.81□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Smok4aA0JLX3 433 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm13040A2A8C4 496 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Man1b1A2AJ15 658 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm13101A2ASJ0 481 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Kcng1A2BDX4 514 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm13119B1ARV5 481 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Lipo4D3Z608 396 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 AhcyP50247 432 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Il11ra2P70225 432 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Hdac2P70288 488 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 UrgcpQ5NCI0 926 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Kcnh1Q60603 989 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 RadilQ69Z89 1099 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Rxfp4Q7TQP4 414 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Acsl5Q8JZR0 683 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 ManbaQ8K2I4 879 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr352Q8VGJ9 315 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Syt12Q920N7 421 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Lactb2Q99KR3 288 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mrps18bQ99N84 254 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ints11Q9CWS4 600 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Psma4Q9R1P0 261 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 DnpepQ9Z2W0 473 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cylc1A0A1B0GR13 642 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 4930402K13RikB1AW18 415 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Vmn2r90E9PXJ8 863 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 St3gal5O88829 414 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mtnd4P03911 459 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Serpinb2P12388 415 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gsta1P13745 223 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Slc2a4P14142 509 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ptpn5P54830 541 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Rps3P62908 243 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 YwhahP68510 246 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Eif2ak2Q03963 515 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 PepdQ11136 493 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Znrf3Q5SSZ7 913 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gsta1Q6P8Q0 223 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cfap97Q6ZPR1 541 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zfp418Q8BFS8 652 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Q8BHR8 331 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Tspan12Q8BKT6 305 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ca9Q8VHB5 437 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pcdhb8Q91XZ2 779 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Slc44a3Q921V7 656 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Nudt17Q9CWD3 296 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Spesp1Q9D5A0 399 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 DguokQ9QX60 277 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Rdh11Q9QYF1 316 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Hs6st1Q9QYK5 411 aa14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 VapaQ9WV55 249 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Plin4O88492 1403 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zfp992B1ASD8 573 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm3636E9Q5P1 227 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm20503G3UZK1 150 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Calhm3J3QMI4 347 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Enpp1P06802 906 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Tap1P21958 724 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Smpdl3bP58242 456 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mdga1Q0PMG2 940 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 IqcmQ149I8 489 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Lrfn1Q2WF71 766 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Hk3Q3TRM8 922 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Glb1l2Q3UPY5 636 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Adam2Q60718 735 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Nfe2l1Q61985 741 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ptbp3Q8BHD7 523 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zbtb33Q8BN78 671 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Q8CDN1 933 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Kdelr3Q8R1L4 214 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zfp991Q8R1N3 573 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zfp940Q8R2Q3 566 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr1311Q8VET0 312 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr1250Q8VGM3 314 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Atp6v1c2Q99L60 427 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ergic3Q9CQE7 383 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ifitm3Q9CQW9 137 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ist1Q9CX00 362 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Erap1Q9EQH2 930 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Wfdc1Q9ESH5 211 aa14.79□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Prokr1Q9JKL1 393 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.8 ms