RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 SAMD11Q96NU1 681 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DMTF1Q9Y222 760 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FAM234BA2RU67 622 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6AP2O75787 350 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 UGT2B17O75795 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC10A3P09131 477 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN5P54829 565 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LGALS3BPQ08380 585 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GLYATQ6IB77 296 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FBXL22Q6P050 247 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FITM2Q8N6M3 262 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 STRA6Q9BX79 667 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RNF39Q9H2S5 420 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PPEF2O14830 753 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SOD2P04179 222 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TAS2R41P59536 307 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OGDHQ02218 1023 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC18A2Q05940 514 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 STX4Q12846 297 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SP140Q13342 867 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SERINC3Q13530 473 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TEAD4Q15561 434 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BEND5Q7L4P6 421 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NACC2Q96BF6 587 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SMOQ99835 787 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NEK6Q9HC98 313 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf109Q9NX04 203 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PLK2Q9NYY3 685 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PTGES3LE9PB15 166 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 H3BNH8 94 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 K7EPI3 171 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LRATO95237 230 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LATS1O95835 1130 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PRKCHP24723 683 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AKT2P31751 481 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 HSPA7P48741 367 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FOXM1Q08050 763 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IL23RQ5VWK5 629 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LIX1Q8N485 282 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 COL26A1Q96A83 441 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ALG2Q9H553 416 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PIP5K1BO14986 540 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ADH5P11766 374 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BMP7P18075 431 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PROZP22891 400 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MTHFRP42898 656 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PEX13Q92968 403 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KIFC1Q9BW19 673 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PALMDQ9NP74 551 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF11O60813 436 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A12O75746 678 aa6.39□□□□□ -1.39
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