RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST8Q9H2A9 424 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 KCND1Q9NSA2 647 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 SOHLH2Q9NX45 425 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM63AO94886 807 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 LPOP22079 712 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 VARSP26640 1264 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBB4BP68371 445 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK18Q07002 472 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBB2AQ13885 445 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 RPE65Q16518 533 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TMTC4Q5T4D3 741 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC70Q6NSX1 233 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMC6Q6NXE6 501 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf96Q7Z7L8 435 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PQLC3Q8N755 202 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTD1Q8N815 330 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FDCSPQ8NFU4 85 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBB2BQ9BVA1 445 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CBX8Q9HC52 389 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 DCTP40126 519 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 AP1B1Q10567 949 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMB3Q13751 1172 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A19Q695T7 634 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 NT5DC3Q86UY8 548 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 AMZ2Q86W34 360 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CPNE8Q86YQ8 564 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 D2HGDHQ8N465 521 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8NA96 180 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS35Q96QK1 796 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT9Q9BW91 350 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 HRASLS2Q9NWW9 162 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5K3A6NET4 321 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP1A2P05177 515 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 GSDMDP57764 484 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 XRCC4Q13426 336 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 NFKBIBQ15653 356 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 IZUMO3Q5VZ72 239 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 OOSP2Q86WS3 158 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PNPLA2Q96AD5 504 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 AGAP3Q96P47 875 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 HEY1Q9Y5J3 304 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ESPL1Q14674 2120 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ13O60928 360 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 POP7O75817 140 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CEACAM4O75871 244 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN1O95832 211 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 RAPSNQ13702 412 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 NR6A1Q15406 480 aa26.73■■□□□ 1.87
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR8K5Q8NH50 307 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 BRSK1Q8TDC3 778 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CLIP3Q96DZ5 547 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR83Q9NYM4 423 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 AURKAO14965 403 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT86O43790 486 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM69BQ5VUD6 431 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CPT1BQ92523 772 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FAF2Q96CS3 445 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf60Q96EN9 201 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FANCEQ9HB96 536 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SPO11Q9Y5K1 396 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 MEN1O00255 615 aa26.71■■□□□ 1.87
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CAPNS1-217ENST00000629983 VAV2P52735 878 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R40P59535 323 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 NFE2L1Q14494 772 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 KYNUQ16719 465 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC38A9Q8NBW4 561 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TCTN2Q96GX1 697 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TCFL5Q9UL49 500 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6C74A6NCV1 312 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 NDST3O95803 873 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB40ALP0C0E4 278 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSCP53634 463 aa26.7■■□□□ 1.86
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