RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 BBS9Q3SYG4 887 aa23.89■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF534Q76KX8 674 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 SRLQ86TD4 932 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 SDR42E2A6NKP2 422 aa23.87■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 PNCKQ6P2M8 343 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 TDRPQ86YL5 185 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 PALM2Q8IXS6 379 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO36Q8NEA4 188 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2W6PQ8NHA6 318 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A51Q9H1U9 297 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 SP110Q9HB58 689 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEB16A2A368 324 aa23.86■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 ELK3P41970 407 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 NPY2RP49146 381 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 GEMP55040 296 aa23.86■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A18Q9H1K4 315 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR26Q9H7D7 661 aa23.86■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 ELFN1P0C7U0 828 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 CES1P23141 567 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 KELP23276 732 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINA4P29622 427 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 GPX6P59796 221 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC14A2Q15849 920 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa23.85■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 BBS5Q8N3I7 341 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 PATE1Q8WXA2 126 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 SPOCK2Q92563 424 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL8AQ96BM9 186 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 AMZ1Q400G9 498 aa23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 TADA1Q96BN2 335 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC24A2Q9UI40 661 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 AK4P27144 223 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 TLE1Q04724 770 aa23.83■■□□□ 1.41
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