RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPAG6O75602 509 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 FURINP09958 794 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 DMPKQ09013 629 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEPT6Q14141 434 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ERV3-1Q14264 604 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 AMZ2Q86W34 360 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF567Q8N184 647 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 FCRL5Q96RD9 977 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCTD3Q9Y597 815 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR2AG2A6NM03 316 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PSTPIP1O43586 416 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNJ13O60928 360 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 KATNA1O75449 491 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TIAF1O95411 115 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPOP01588 193 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 FECHP22830 423 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC1A5Q15758 541 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 IGFBP7Q16270 282 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPE65Q16518 533 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP2R5EQ16537 467 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 IPMKQ8NFU5 416 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 P3H4Q92791 437 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 HAUS1Q96CS2 278 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 HACD3Q9P035 362 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 INTUQ9ULD6 942 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 NBASA2RRP1 2371 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 MTSS1O43312 755 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOXK1P85037 733 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 NFE2L1Q14494 772 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PID1Q7Z2X4 250 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM135Q86UB9 458 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 22.9
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ALG6Q9Y672 507 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOLR1P15328 257 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 HLA-DPA1P20036 260 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 NR1D1P20393 614 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 MPP3Q13368 585 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TUBB3Q13509 450 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ITGA9Q13797 1035 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNAB1Q14722 419 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 UBXN4Q92575 508 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 VAT1Q99536 393 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDE7BQ9NP56 450 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 LHX9Q9NQ69 397 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCND3Q9UK17 655 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PADI1Q9ULC6 663 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 POLHQ9Y253 713 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PKP3Q9Y446 797 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDC14CA4D256 554 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 K7EM74 188 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 MT-ND3P03897 115 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 MARCKSL1P49006 195 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 DNASE1L3Q13609 305 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 PTPRCAPQ14761 206 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLCL1Q15111 1095 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 CT55Q8WUE5 264 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAP3K3Q99759 626 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMOXQ9NWM0 555 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 RARRES3Q9UL19 164 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.32■□□□□ 0.84
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