RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DEFA5Q01523 94 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CES3Q6UWW8 571 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 UBR7Q8N806 425 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR2T12Q8NG77 320 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SPACA7Q96KW9 195 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SNX15Q9NRS6 342 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ALOX15BO15296 676 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 EPHA3P29320 983 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DNASE1L1P49184 302 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SMARCB1Q12824 385 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 C16orf46Q6P387 395 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GPR180Q86V85 440 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MIB1Q86YT6 1006 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GAKO14976 1311 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0J9YYE9 177 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PLD2O14939 933 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FGFR1P11362 822 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP8P85298 464 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 HIPK3Q9H422 1215 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 COPZ2Q9P299 210 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 IFT172Q9UG01 1749 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RAB19A4D1S5 217 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NOTOA8MTQ0 251 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFS2O75306 463 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PPM1BO75688 479 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CTSEP14091 401 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TPH1P17752 444 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GNAZP19086 355 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SULT2A1Q06520 285 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NTRK3Q16288 839 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CPTPQ5TA50 214 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PRELID2Q8N945 189 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ASLP04424 464 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CCNB1P14635 433 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SLC5A3P53794 718 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ADAM15Q13444 863 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RHOJQ9H4E5 214 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PXMP2Q9NR77 195 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PRKD3O94806 890 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CASRP41180 1078 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RGS19P49795 217 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ORC1Q13415 861 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CA9Q16790 459 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DNERQ8NFT8 737 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 UFD1Q92890 307 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 J3QR89 54 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GJB6O95452 261 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF12O95522 483 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FABP3P05413 133 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RBL1P28749 1068 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 QPCTQ16769 361 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FAM151AQ8WW52 585 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms