RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592991.1

LDLRAD4-218, Transcript of low density lipoprotein receptor class A domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LDLRAD4, Length 1,640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD4-218ENST00000592991 INPP5DQ92835 1189 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 PANX3Q96QZ0 392 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 SYTL2Q9HCH5 934 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 BDP1A6H8Y1 2624 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TFEBP19484 476 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TRIM23P36406 574 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 PRLHRP49683 370 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TECRLQ5HYJ1 363 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 AGAP9Q5VTM2 703 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TMEM151AQ8N4L1 468 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 ASB12Q8WXK4 309 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 FOXJ1Q92949 421 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 ALG9Q9H6U8 611 aa25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 LATO43561 262 aa25.18■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 LILRB5O75023 590 aa25.18■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 ELMO1Q92556 727 aa25.18■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 BIRC7Q96CA5 298 aa25.18■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 KCNA4P22459 653 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 AOAHP28039 575 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TEAD1P28347 426 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 CCR3P51677 355 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 IL2P60568 153 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 IL9RQ01113 521 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 GTF2H3Q13889 308 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 PCLAFQ15004 111 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 OR4D1Q15615 310 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 CCDC153Q494R4 210 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 CCDC91Q7Z6B0 441 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 ZNF547Q8IVP9 402 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 CKAP2Q8WWK9 683 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 SNX19Q92543 992 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 APOOQ9BUR5 198 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 DERL2Q9GZP9 239 aa25.17■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 CDC7O00311 574 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 VEGFDO43915 354 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 MAGEC1O60732 1142 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 AOC1P19801 751 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 SLC26A3P40879 764 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 KCNC1P48547 511 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 HSPA14Q0VDF9 509 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 GCNT7Q6ZNI0 430 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 ISCA2Q86U28 154 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 LCA5Q86VQ0 697 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 VRK3Q8IV63 474 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 DENND6BQ8NEG7 585 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 EXT2Q93063 718 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 ANKRD12Q6UB98 2062 aa25.16■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 G3V2L1 256 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 AXIN1O15169 862 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 FTH1P02794 183 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 CCR5P51681 352 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TERF2Q15554 542 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TSNQ15631 228 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 BCL7AQ4VC05 210 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TPRG1LQ5T0D9 272 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 KLC3Q6P597 504 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 BMFQ96LC9 184 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 LATS2Q9NRM7 1088 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 COPG2Q9UBF2 871 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TARM1B6A8C7 271 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 BTN3A1O00481 513 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 FPGTO14772 594 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 BPGMP07738 259 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 BGNP21810 368 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 ALDH3A1P30838 453 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 LSP1P33241 339 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 ACAP2Q15057 778 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 C10orf107Q8IVU9 208 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 TM7SF3Q9NS93 570 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 GULP1Q9UBP9 304 aa25.15■■□□□ 1.62
LDLRAD4-218ENST00000592991 NEMP2A6NFY4 417 aa25.14■■□□□ 1.61
LDLRAD4-218ENST00000592991 TMEM221A6NGB7 291 aa25.14■■□□□ 1.61
LDLRAD4-218ENST00000592991 M0R296 226 aa25.14■■□□□ 1.61
LDLRAD4-218ENST00000592991 FUCA1P04066 466 aa25.14■■□□□ 1.61
LDLRAD4-218ENST00000592991 CPA3P15088 417 aa25.14■■□□□ 1.61
LDLRAD4-218ENST00000592991 AKT2P31751 481 aa25.14■■□□□ 1.61
LDLRAD4-218ENST00000592991 PREPP48147 710 aa25.14■■□□□ 1.61
LDLRAD4-218ENST00000592991 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa25.14■■□□□ 1.61
LDLRAD4-218ENST00000592991 CCM2Q9BSQ5 444 aa25.14■■□□□ 1.61
LDLRAD4-218ENST00000592991 IER2Q9BTL4 223 aa25.14■■□□□ 1.61
LDLRAD4-218ENST00000592991 TSSK1BQ9BXA7 367 aa25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms