RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 KCNJ9Q92806 393 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ARRDC3Q96B67 414 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC126Q96EE4 140 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 COQ10AQ96MF6 247 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ACOX2Q99424 681 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 GPR22Q99680 433 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 MKS1Q9NXB0 559 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ACOT9Q9Y305 439 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PP55 124 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 COPEO14579 308 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 KDM1AO60341 852 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SLC4A1P02730 911 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 RBP1P09455 135 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PIRTP0C851 137 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 C6P13671 934 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 AOC1P19801 751 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 VAMP1P23763 118 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ACRV1P26436 265 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 AKT1P31749 480 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 GKP32189 559 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 FOXN2P32314 431 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 DRD3P35462 400 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 WASP42768 502 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SLC1A2P43004 574 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TPMTP51580 245 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PRKAA2P54646 552 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ADPRHP54922 357 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 RAB10P61026 200 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ATP6V0D1P61421 351 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 MESP2Q0VG99 397 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 IHHQ14623 411 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC153Q494R4 210 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 MACC1Q6ZN28 852 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 Q6ZVL8 140 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 RAPH1Q70E73 1250 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 IQCHQ86VS3 1027 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 AADATQ8N5Z0 425 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF366Q8N895 744 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 GDAP1Q8TB36 358 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 RDH11Q8TC12 318 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 DCAKDQ8WVC6 231 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 HMGB4Q8WW32 186 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 GLYATL1Q969I3 302 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ISL2Q96A47 359 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 HIC2Q96JB3 615 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 HHIPQ96QV1 700 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF446Q9NWS9 450 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 OGFRQ9NZT2 677 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 MUTYHQ9UIF7 546 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SARDHQ9UL12 918 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 GPR34Q9UPC5 381 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 COL4A2P08572 1712 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PQU0 124 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SMIM23A6NLE4 172 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TTC36A6NLP5 189 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SYCE1LA8MT33 242 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TNFRSF10CO14798 259 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 LAMTOR5O43504 91 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ADAM11O75078 769 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms