RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PQ72	361 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OR5K4	A6NMS3	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TISP43	B9A030	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OVOL3	O00110	214 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SLC27A2	O14975	620 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA0513	O60268	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	NEMF	O60524	1076 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SNAP91	O60641	907 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	BMP10	O95393	424 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PRR35	P0CG20	571 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	HKR1	P10072	659 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	F3	P13726	295 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ACVR1B	P36896	505 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	NUMB	P49757	651 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	MTTP	P55157	894 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	DCDC1	P59894	354 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	GTF2B	Q00403	316 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	FOXO1	Q12778	655 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	POSTN	Q15063	836 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	GPR19	Q15760	415 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CD180	Q99467	661 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SYCE3	A1L190	88 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	STX6	O43752	255 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ADAM11	O75078	769 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ZBED1	O96006	694 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	F10	P00742	488 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	IFNAR1	P17181	557 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SYT1	P21579	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TEAD1	P28347	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	GZMK	P49863	264 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ME3	Q16798	604 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	NTNG2	Q96CW9	530 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ART5	Q96L15	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	WDR54	Q9H977	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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