RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SLC6A19	Q695T7	634 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL35	Q6PF15	583 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	D2HGDH	Q8N465	521 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GPR150	Q8NGU9	434 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	OR8K5	Q8NH50	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	MR1	Q95460	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	FAF2	Q96CS3	445 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TCTN2	Q96GX1	697 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	LRFN5	Q96NI6	719 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	VPS35	Q96QK1	796 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CD180	Q99467	661 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	LUZP4	Q9P127	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF711	Q9Y462	761 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PCM1	Q15154	2024 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	KCNK1	O00180	336 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SCRG1	O75711	98 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM63A	O94886	807 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PIRT	P0C851	137 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	HAL	P42357	657 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TUBB4B	P68371	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	HSD11B2	P80365	405 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	DMPK	Q09013	629 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TUBB2A	Q13885	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PDK2	Q15119	407 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	RPE65	Q16518	533 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PQLC3	Q8N755	202 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	NUDT9	Q9BW91	350 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	MFRP	Q9BY79	579 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	KCND1	Q9NSA2	647 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	OR5K3	A6NET4	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	MYO1F	O00160	1098 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CBX6	O95503	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SLC4A1	P02730	911 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CYP1A2	P05177	515 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ARL4D	P49703	201 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GSDMD	P57764	484 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GPR19	Q15760	415 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	STX1A	Q16623	288 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	LCN10	Q6JVE6	187 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	KCTD6	Q8NC69	237 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	NLN	Q9BYT8	704 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SNX7	Q9UNH6	387 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	MEN1	O00255	615 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	AURKA	O14965	403 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF185	O15231	689 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	KRT86	O43790	486 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CAPN1	P07384	714 aa		11.11	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms