RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	P2RY12	Q9H244	342 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF639	Q9UID6	485 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PHF24	Q9UPV7	400 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GJB5	O95377	273 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	NCK1	P16333	377 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	IL12A	P29459	219 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TM4SF4	P48230	202 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CDH15	P55291	814 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	NUP107	P57740	925 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TRAF2	Q12933	501 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	BIRC7	Q96CA5	298 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM74	Q96NL1	305 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	COCH	O43405	550 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	STC2	O76061	302 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	OTC	P00480	354 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN1	P07384	714 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CDH1	P12830	882 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	MSH3	P20585	1137 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	HPCA	P84074	193 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ESAM	Q96AP7	390 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM14	Q96QK8	99 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CHID1	Q9BWS9	393 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	OCEL1	Q9H607	264 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559		H0YAE9	185 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	RAD51B	O15315	384 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	HOXA2	O43364	376 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GMNN	O75496	209 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	KLKB1	P03952	638 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ELN	P15502	786 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SFRP1	Q8N474	314 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TERB1	Q8NA31	727 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	IL17C	Q9P0M4	197 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF711	Q9Y462	761 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ASB1	Q9Y576	335 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	JAK1	P23458	1154 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	HRH2	P25021	359 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	HMGCL	P35914	325 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	RGS4	P49798	205 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ARF5	P84085	180 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TWF1	Q12792	350 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2H2	Q13888	395 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	NR6A1	Q15406	480 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GLYAT	Q6IB77	296 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GALT	P07902	379 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PWP1	Q13610	501 aa		18.15	■□□□□ 0.5

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