RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TK2	O00142	265 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE1B	Q01064	536 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ART4	Q93070	314 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	DDA1	Q9BW61	102 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB8	Q9H765	288 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2AG2	A6NM03	316 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP6	O43182	974 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	C9	P02748	559 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK9	P45984	424 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RHD	Q02161	417 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	XKR5	Q6UX68	686 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SGF29	Q96ES7	293 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMYND15	Q9H091	742 aa		21.37	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MU76	341 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SGTA	O43765	313 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT86	O43790	486 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	UBXN7	O94888	489 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	MSH3	P20585	1137 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	P3H1	Q32P28	736 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A7	Q92504	469 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC9	Q92623	222 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		21.36	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	EFCAB7	A8K855	629 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	STMND1	H3BQB6	276 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	AP2A1	O95782	977 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	HADHA	P40939	763 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	GFER	P55789	205 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB15	P59190	212 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	MC2R	Q01718	297 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR18	Q14330	331 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	NFE2L1	Q14494	772 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL7A	Q4VC05	210 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	METRNL	Q641Q3	311 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM129C	Q86XR2	697 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	WBP1	Q96G27	269 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRY4	Q9C004	299 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		21.35	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200		H7C0S8	307 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	LIAS	O43766	372 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TYRP1	P17643	537 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	AKT1	P31749	480 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RPE65	Q16518	533 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKS6	Q68DC2	871 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	DET1	Q7L5Y6	550 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	NXPE1	Q8N323	547 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	NAT14	Q8WUY8	206 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC45	Q96CN5	670 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf72	Q96LT7	481 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL3	Q9UH77	587 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	MGAT4D	A6NG13	374 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL22	O00626	93 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QL1	O75973	258 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TPH1	P17752	444 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMA3	P25788	255 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	HAL	P42357	657 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPZB	P47756	277 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS15	P98073	1019 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX20	Q7Z614	316 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	VASH2	Q86V25	355 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR150	Q8NGU9	434 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2L2	Q8NH16	312 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RSC1A1	Q92681	617 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	NKD1	Q969G9	470 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ULK4	Q96C45	1275 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		21.33	■■□□□ 1.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms