RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	AARD	Q4LEZ3	155 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf89	Q6UX73	402 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TLK2	Q86UE8	772 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C4orf19	Q8IY42	314 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM1B	Q8NB78	822 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C14orf79	Q96F83	325 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM68	Q96MH6	324 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS14	Q96SY0	518 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GAD1	Q99259	594 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PKP4	Q99569	1192 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	INPP5K	Q9BT40	448 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CD93	Q9NPY3	652 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SETD4	Q9NVD3	440 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO40	Q9UH90	709 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM94	Q12767	1356 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3R4	Q99570	1358 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SYCE3	A1L190	88 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CTAGE9	A4FU28	777 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM247	A6NEH6	219 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf52	A6NGY3	159 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	VWA5A	O00534	786 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ACOT8	O14734	319 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01565	O15544	149 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP104	O60308	925 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP3	O75969	853 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	REC8	O95072	547 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	EPN2	O95208	641 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNB1	P01574	187 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GHR	P10912	638 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GZMA	P12544	262 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT5	P13647	590 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PDGFRA	P16234	1089 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	AHCY	P23526	432 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IL4R	P24394	825 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMLG	P49069	296 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GNAQ	P50148	359 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTR1A	P61163	376 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SIRPA	P78324	504 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNA1	P78396	465 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	COG7	P83436	770 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKCE	Q02156	737 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RUNX1T1	Q06455	604 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CETN1	Q12798	172 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GAB1	Q13480	694 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	BFSP2	Q13515	415 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNC3	Q14003	757 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SNAPC1	Q16533	368 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SGCB	Q16585	318 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IGSF11	Q5DX21	431 aa		2.79	□□□□□ -1.96

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