RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 RAB6CQ9H0N0 254 aa9.44□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.44□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa9.44□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.44□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 HPSEQ9Y251 543 aa9.44□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TACC2O95359 2948 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC78A2IDD5 438 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 SLC19A2O60779 497 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 PGLSO95336 258 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 GPR89BP0CG08 455 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CYP11B1P15538 503 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CDH3P22223 829 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 HTR7P34969 479 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 PTPN9P43378 593 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 PREPP48147 710 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 MEOX1P50221 254 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFA8P51970 172 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TRAF2Q12933 501 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 PRKAA1Q13131 559 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CEBPEQ15744 281 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 LONRF1Q17RB8 773 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CES4AQ5XG92 561 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 OR2Y1Q8NGV0 311 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 SUN3Q8TAQ9 357 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 GPT2Q8TD30 523 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CRACR2AQ9BSW2 395 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 LHPPQ9H008 270 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 OR2AG1Q9H205 316 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 HRASLS2Q9NWW9 162 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 COQ3Q9NZJ6 369 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ATXN10Q9UBB4 475 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.43□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV17A0A0B4J275 112 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ANKRD62A6NC57 917 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 OR5K3A6NET4 321 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 VEGFDO43915 354 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ZWINTO95229 277 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 RASAL1O95294 804 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 SMC2O95347 1197 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 LCA5LO95447 670 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 MYBL2P10244 700 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 PPP1R2P41236 205 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 STC1P52823 247 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 AIF1P55008 147 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 PTSQ03393 145 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 PTPRRQ15256 657 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TAF3Q5VWG9 929 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 GBP6Q6ZN66 633 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 EID3Q8N140 333 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF599Q96NL3 588 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 GSDMAQ96QA5 445 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 NOD2Q9HC29 1040 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 TINAGQ9UJW2 476 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 CDC23Q9UJX2 597 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.42□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 BICDL2A1A5D9 508 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF749O43361 778 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 MLYCDO95822 493 aa9.41□□□□□ -0.9
SMAD3-211ENST00000559460 F13A1P00488 732 aa9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.3 ms