RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	MFAP4	P55083	255 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787		A6NCN8	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLPP2	O43688	288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR2C1	O95371	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	LDLR	P01130	860 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	LIPF	P07098	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	INHBA	P08476	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF224	P0DH78	156 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GJA1	P17302	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GABRB1	P18505	474 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CASP2	P42575	452 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARSE	P51690	589 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MC1R	Q01726	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	HYI	Q5T013	277 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787		Q75L30	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	VPREB1	P12018	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GNAZ	P19086	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TM4SF1	P30408	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	WTAP	Q15007	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	STPG4	Q8N801	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	STK26	Q9P289	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPR137B	O60478	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	NR3C1	P04150	777 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAPK4	P31152	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	HADHA	P40939	763 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNJ10	P78508	379 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLC3	Q6P597	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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