RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
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PTPRB-209ENST00000550857 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-209ENST00000550857 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-209ENST00000550857 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-209ENST00000550857 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.95□□□□□ -1.14
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