RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 TP73O15350 636 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SOX30O94993 753 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 IL33O95760 270 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 NPIPA8P0DM63 369 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF3P17036 446 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 JUNDP17535 347 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 TYMPP19971 482 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 AVPR1AP37288 418 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 ARF5P84085 180 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 PRKCQQ04759 706 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 BST1Q10588 318 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 TDGQ13569 410 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 CCNIQ14094 377 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 DSC3Q14574 896 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 KCNJ11Q14654 390 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SYT16Q17RD7 645 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 TBRG1Q3YBR2 411 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 RRM2BQ7LG56 351 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 ACOT1Q86TX2 421 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM192Q8IY95 271 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 THEM5Q8N1Q8 247 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 DTX3Q8N9I9 347 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 RCN3Q96D15 328 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 RNFT2Q96EX2 444 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 CRELD1Q96HD1 420 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 MECRQ9BV79 373 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 XKR8Q9H6D3 395 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 EBF1Q9UH73 591 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 MRASO14807 208 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 INPPL1O15357 1258 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 VNN2O95498 520 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SLC10A3P09131 477 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 RAB2AP61019 212 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 PPP2R2BQ00005 443 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 KRT33BQ14525 404 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 PHKG1Q16816 387 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 TIGD3Q6B0B8 471 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 C16orf46Q6P387 395 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 USP43Q70EL4 1123 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 CLYBLQ8N0X4 340 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 EMC1Q8N766 993 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SLC2A13Q96QE2 648 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 KCNS3Q9BQ31 491 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC32Q9BV29 185 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 POPDC2Q9HBU9 364 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 RGS18Q9NS28 235 aa6□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 MED11Q9P086 117 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 AASSQ9UDR5 926 aa6□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 TRAPPC13A5PLN9 417 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 ANXA9O76027 345 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 GJB1P08034 283 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 ETV1P50549 477 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC74AQ0VAA2 488 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 UBA3Q8TBC4 463 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SMARCD1Q96GM5 515 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 FN3KQ9H479 309 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SLC7A8Q9UHI5 535 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 KAT6AQ92794 2004 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 H0YAE9 185 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 GNRH1P01148 92 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 THP07101 528 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 RARBP10826 455 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 CYP2F1P24903 491 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 IL1R2P27930 398 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 PKLRP30613 574 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 FMO4P31512 558 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 GRIA1P42261 906 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 CDC42P60953 191 aa5.99□□□□□ -1.45
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