RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526044.5

USP48-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

TSL 3

Gene USP48, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-211ENST00000526044 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 MAGEA1P43355 309 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 ABCG1P45844 678 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SNX16P57768 344 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 KRTAP10-11P60412 298 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 ROR1Q01973 937 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 CAMK1Q14012 370 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 PTPN14Q15678 1187 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 MEA1Q16626 185 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 MAPKAPK3Q16644 382 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 CCDC122Q5T0U0 273 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 PLPP4Q5VZY2 271 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 TPGS2Q68CL5 300 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 CFAP161Q6P656 301 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 VSTM1Q6UX27 236 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SRLQ86TD4 932 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 P3H2Q8IVL5 708 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 WDTC1Q8N5D0 677 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 TMEM35BQ8NCS4 154 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SPPL2BQ8TCT7 592 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SLC2A14Q8TDB8 520 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 MYLPFQ96A32 169 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 C5orf34Q96MH7 638 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 WDR24Q96S15 920 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 PKMYT1Q99640 499 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 UBXN6Q9BZV1 441 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 TLE6Q9H808 572 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 USP29Q9HBJ7 922 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.6□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 A0A087X0T9 212 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 FAM234BA2RU67 622 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 MTMR11A4FU01 709 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 A6NCN8 305 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 EPOPA6NHQ4 379 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 TMCO5BA8MYB1 307 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 M0QYV0 167 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 CLIC1O00299 241 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 PRRG1O14668 218 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 BEST1O76090 585 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SEC24AO95486 1093 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 LSM8O95777 96 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 GLUD1P00367 558 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 FAM228BP0C875 321 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 FAM200BP0CF97 657 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SETSIPP0DME0 302 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 GPD2P43304 727 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 MAGEA11P43364 429 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 ACADSBP45954 432 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 TSC2P49815 1807 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 MAP3K7CLP57077 242 aa4.59□□□□□ -1.67
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USP48-211ENST00000526044 GPC5P78333 572 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 KRT83P78385 493 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 BTKQ06187 659 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 BST2Q10589 180 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 DNASE1L3Q13609 305 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 ATP1A4Q13733 1029 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SPA17Q15506 151 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 TAF12Q16514 161 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 SLC18A3Q16572 532 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 CFAP221Q4G0U5 840 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 CEP78Q5JTW2 689 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 C10orf76Q5T2E6 689 aa4.59□□□□□ -1.67
USP48-211ENST00000526044 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.59□□□□□ -1.67
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