RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A0U1RQJ8	604 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	PRR19	A6NJB7	356 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ARHGAP6	O43182	974 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	NRDC	O43847	1150 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	GAS8	O95995	478 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	TYRP1	P17643	537 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	CTSC	P53634	463 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	TMPRSS15	P98073	1019 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	OLIG2	Q13516	323 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	SPARCL1	Q14515	664 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	PTPRCAP	Q14761	206 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	KLHL35	Q6PF15	583 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	DET1	Q7L5Y6	550 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	LINC00523	Q86TU6	105 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ZPBP	Q9BS86	351 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	EFS	O43281	561 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	RASSF9	O75901	435 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	BRAF	P15056	766 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	CAPZB	P47756	277 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	LMAN1	P49257	510 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	MC2R	Q01718	297 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	SEPT6	Q14141	434 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	GPR18	Q14330	331 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	NFE2L1	Q14494	772 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	PLCL1	Q15111	1095 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	GPR33	Q49SQ1	333 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ANKS6	Q68DC2	871 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	SNX20	Q7Z614	316 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	VASH2	Q86V25	355 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	DTX1	Q86Y01	620 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	SGF29	Q96ES7	293 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	C9orf72	Q96LT7	481 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	TGM7	Q96PF1	710 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	COPS8	Q99627	209 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	KCTD3	Q9Y597	815 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	CACNA1G	O43497	2377 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	MGAT4D	A6NG13	374 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393		E7EVH7	732 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	METTL18	O95568	372 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	AP2A1	O95782	977 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	C9	P02748	559 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC175	P0C221	793 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	MC4R	P32245	332 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	GDF10	P55107	478 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	GFER	P55789	205 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	XIAP	P98170	497 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	LAMB3	Q13751	1172 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	KRT33B	Q14525	404 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	GSE1	Q14687	1217 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	CLCA4	Q14CN2	919 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	RPS6KA1	Q15418	735 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	BCL7A	Q4VC05	210 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	METRNL	Q641Q3	311 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	KCTD11	Q693B1	232 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	IRGC	Q6NXR0	463 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	NXPE1	Q8N323	547 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	BMPER	Q8N8U9	685 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	OR2L2	Q8NH16	312 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RBBP4-215	ENST00000524393	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43

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