RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PTOV1Q86YD1 416 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 HACE1Q8IYU2 909 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SEMA4DQ92854 862 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 LITAFQ99732 161 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MUC13Q9H3R2 512 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 C2CD2Q9Y426 696 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SMARCA4P51532 1647 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MYO1GB0I1T2 1018 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 HHLA1C9JL84 531 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 HS6ST1O60243 411 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TMCC2O75069 709 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 DDX58O95786 925 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ACADLP28330 430 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 EPHA2P29317 976 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 DRG2P55039 364 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PRAMEP78395 509 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SETQ01105 290 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MVPQ14764 893 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 FAAH2Q6GMR7 532 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SARM1Q6SZW1 724 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CLEC17AQ6ZS10 378 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CEP97Q8IW35 865 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MOAP1Q96BY2 351 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 LGALS12Q96DT0 336 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 DDOQ99489 341 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 GFI1Q99684 422 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.94□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 OR2M5A3KFT3 312 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PLOD2O00469 737 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 LDLRP01130 860 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CLTBP09497 229 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ACTN1P12814 892 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CKMT2P17540 419 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 NR2C2P49116 596 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CAMPP49913 170 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MMP15P51511 669 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MAMLD1Q13495 774 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 RAB6CQ53S08 254 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SNX30Q5VWJ9 437 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF534Q76KX8 674 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TICAM1Q8IUC6 712 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ITPAQ9BY32 194 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 RAB6CQ9H0N0 254 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 DNAJC18Q9H819 358 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TSPYL4Q9UJ04 414 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PNMA2Q9UL42 364 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 FLT1P17948 1338 aa3.93□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 HMGXB3Q12766 1538 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TPPPO94811 219 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TSHBP01222 138 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CD48P09326 243 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PRSS56P0CW18 603 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 LAMP2P13473 410 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MAP2K2P36507 400 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PSMC4P43686 418 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PMP22Q01453 160 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CRYMQ14894 314 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC30Q5VVM6 783 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 GALNT13Q8IUC8 556 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 WDTC1Q8N5D0 677 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 NGEFQ8N5V2 710 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SCFD2Q8WU76 684 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SMPDL3BQ92485 455 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 USP6NLQ92738 828 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MPP4Q96JB8 637 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 OR2A14Q96R47 310 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ECHDC1Q9NTX5 307 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MIOSQ9NXC5 875 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 OGFRQ9NZT2 677 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 DNAJB4Q9UDY4 337 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ACAD8Q9UKU7 415 aa3.92□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 A0A087X0M5 115 aa3.91□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 A0A1B0GX30 115 aa3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms