RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 EGLN2Q96KS0 407 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 HARBI1Q96MB7 349 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM68Q96MH6 324 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 FOXN4Q96NZ1 517 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 AGAP3Q96P47 875 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SMC6Q96SB8 1091 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SEMA3CQ99985 751 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 LAT2Q9GZY6 243 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SIL1Q9H173 461 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PIGMQ9H3S5 423 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAGIXQ9H6Y5 334 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 VEZTQ9HBM0 779 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 COPG2Q9UBF2 871 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 STK39Q9UEW8 545 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 GJD2Q9UKL4 321 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KLK13Q9UKR3 277 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SARDHQ9UL12 918 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MKLN1Q9UL63 735 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TBX20Q9UMR3 447 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 YIPF1Q9Y548 306 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CSAG2Q9Y5P2 127 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CLIC4Q9Y696 253 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KAT6BQ8WYB5 2073 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1W2PQF6 199 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1W2PRG0 241 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KANSL1LA0AUZ9 987 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR2M5A3KFT3 312 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 C15orf62A8K5M9 175 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KLLNB2CW77 178 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TGFB1I1O43294 461 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLPP2O43688 288 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PAGE4O60829 102 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF217O75362 1048 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 AP2A2O94973 939 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 LDHAP00338 332 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 F9P00740 461 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGHV4-59P01825 116 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 RAF1P04049 648 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 POLBP06746 335 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 HMBSP08397 361 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 HRH2P25021 359 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 NFKBIAP25963 317 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CNTFP26441 200 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ABCD3P28288 659 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ICAM3P32942 547 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 HALP42357 657 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRCPP42785 496 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PAFAH1B1P43034 410 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC6A12P48065 614 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 HLCSP50747 726 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 THOP1P52888 689 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CTSCP53634 463 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 F2RL1P55085 397 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 RHBDL3P58872 404 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TAS2R40P59535 323 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CD81P60033 236 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 VAMP2P63027 116 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KCNJ10P78508 379 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MFAP5Q13361 173 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TRPC3Q13507 836 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 P2RY6Q15077 328 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TAF12Q16514 161 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 GRAMD1BQ3KR37 738 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC25A30Q5SVS4 291 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 LRIF1Q5T3J3 769 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM69AQ5T7M9 428 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CYP4A22Q5TCH4 519 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ARHGEF16Q5VV41 709 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ALS2CLQ60I27 953 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CDC73Q6P1J9 531 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TRIM65Q6PJ69 517 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 DOK6Q6PKX4 331 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TSSK4Q6SA08 328 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CYP26C1Q6V0L0 522 aa0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms